Das überlieferte Werk des in Erfurt und Eisenach tätigen Kirchenmusikers und Hofcembalisten ist zwar nicht umfangreich, doch stehen die Werke zuweilen in direkter Verbindung zu Johann Sebastian, der die Orchesterwerke seines Vetters (zweiten Grades) zu Studienzwecken kopierte. Johann Bernhards zeittypische Chaconne-Kompositionen werden in einer wichtigen Quelle sogar dem berühmten Verwandten direkt zugeschrieben.